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Hoodbhoy ha impartido clases en el departamento de física de la Universidad Quaid-e-Azam en Islamabad durante 40 años y ahora es profesor en el Forman Christian College en Lahore. Ha ganado numerosos premios, incluyendo el Premio Abdus Salam de Matemáticas, el Premio por el Libro del Año por parte del Consejo Nacional del Libro de Pakistán y el Premio Kalinga de la UNESCO para la popularización de las ciencias. Además de la producción de muchos documentales para la televisión paquistaní, ha escrito los siguientes libros, Islam and Science: Religious Orthodoxy and the Battle for Rationality, Education and the State: Fifty Years of Pakistan y Confronting the Bomb: Pakistani and Indian Scientists Speak Out (El islam y la ciencia: la ortodoxia religiosa y la batalla por la racionalidad, La educación y el estado: cincuenta años de Pakistán y Enfrentando a la bomba: los científicos paquistaníes e indios hablan claro). Es miembro del Consejo de Patrocinadores del Bulletin.